webPSN

Color	Trajectory Frequency
	0 < Freq. ≤ 10
	10 < Freq. ≤ 20
	20 < Freq. ≤ 30
	30 < Freq. ≤ 40
	40 < Freq. ≤ 50
	50 < Freq. ≤ 60
	60 < Freq. ≤ 70
	70 < Freq. ≤ 80
	80 < Freq. ≤ 90
	90 < Freq. ≤ 100

Index	Node1	Node2	Freq	Hub1?	Hub2?	Community
1	A:A:1	A:A:2	100	No	No	0
2	A:A:2	A:A:3	100	No	No	0
3	A:A:2	A:A:5	100	No	No	0
4	A:A:3	A:A:4	100	No	No	0
5	A:A:5	A:A:6	100	No	No	0
6	A:A:6	A:A:7	100	No	Yes	0
7	A:A:7	A:A:8	100	Yes	No	0
8	A:A:7	A:A:89	100	Yes	No	0
9	A:A:7	A:A:91	100	Yes	Yes	0
10	A:A:8	A:A:9	100	No	No	1
11	A:A:8	A:A:86	100	No	Yes	1
12	A:A:86	A:A:9	100	Yes	No	1
13	A:A:87	A:A:9	100	No	No	1
14	A:A:10	A:A:11	100	No	No	0
15	A:A:11	A:A:85	100	No	No	0
16	A:A:13	A:A:14	100	Yes	No	0
17	A:A:13	A:A:16	100	Yes	No	0
18	A:A:13	A:A:81	100	Yes	No	0
19	A:A:14	A:A:15	100	No	No	0
20	A:A:14	A:A:17	100	No	No	0
21	A:A:15	A:A:16	100	No	No	0
22	A:A:16	A:A:17	100	No	No	0
23	A:A:17	A:A:18	100	No	No	0
24	A:A:20	A:A:21	100	No	No	0
25	A:A:21	A:A:22	100	No	Yes	0
26	A:A:22	A:A:23	100	Yes	No	0
27	A:A:22	A:A:71	100	Yes	Yes	0
28	A:A:23	A:A:24	100	No	No	0
29	A:A:26	A:A:27	100	No	No	0
30	A:A:27	A:A:28	100	No	No	0
31	A:A:28	A:A:29	100	No	No	0
32	A:A:29	A:A:30	100	No	No	0
33	A:A:30	A:A:31	100	No	No	0
34	A:A:31	A:A:32	100	No	No	0
35	A:A:31	A:A:36	100	No	Yes	0
36	A:A:35	A:A:36	100	No	Yes	0
37	A:A:35	A:A:58	100	No	No	0
38	A:A:36	A:A:37	100	Yes	No	0
39	A:A:36	A:A:57	100	Yes	Yes	0
40	A:A:37	A:A:38	100	No	No	0
41	A:A:40	A:A:41	100	No	No	0
42	A:A:41	A:A:42	100	No	Yes	0
43	A:A:42	A:A:43	100	Yes	No	0
44	A:A:42	A:A:47	100	Yes	No	0
45	A:A:47	A:A:48	100	No	No	0
46	A:A:48	A:A:49	100	No	No	0
47	A:A:49	A:A:51	100	No	No	0
48	A:A:51	A:A:52	100	No	No	0
49	A:A:52	A:A:53	100	No	Yes	0
50	A:A:52	A:A:89	100	No	No	0
51	A:A:53	A:A:54	100	Yes	No	0
52	A:A:53	A:A:56	100	Yes	No	0
53	A:A:56	A:A:91	100	No	Yes	0
54	A:A:57	A:A:58	100	Yes	No	2
55	A:A:57	A:A:59	100	Yes	No	2
56	A:A:57	A:A:90	100	Yes	No	0
57	A:A:58	A:A:59	100	No	No	2
58	A:A:61	A:A:62	100	Yes	No	0
59	A:A:61	A:A:64	100	Yes	No	0
60	A:A:64	A:A:65	100	No	No	0
61	A:A:65	A:A:66	100	No	No	0
62	A:A:66	A:A:67	100	No	No	0
63	A:A:70	A:A:71	100	No	Yes	0
64	A:A:71	A:A:72	100	Yes	No	0
65	A:A:72	A:A:73	100	No	No	0
66	A:A:75	A:A:76	100	No	Yes	0
67	A:A:76	A:A:77	100	Yes	No	0
68	A:A:76	A:A:79	100	Yes	No	3
69	A:A:76	A:A:80	100	Yes	No	3
70	A:A:77	A:A:78	100	No	No	0
71	A:A:78	A:A:79	100	No	No	0
72	A:A:79	A:A:80	100	No	No	3
73	A:A:80	A:A:81	100	No	No	0
74	A:A:83	A:A:84	100	No	No	0
75	A:A:84	A:A:85	100	No	No	0
76	A:A:85	A:A:86	100	No	Yes	0
77	A:A:86	A:A:87	100	Yes	No	1
78	A:A:87	A:A:88	100	No	No	0
79	A:A:88	A:A:89	100	No	No	0
80	A:A:90	A:A:91	100	No	Yes	0
81	A:A:93	A:A:94	100	No	No	0
82	A:A:71	B:B:4	100	Yes	No	0
83	A:A:71	A:A:75	45.97	Yes	No	0
84	A:A:23	A:A:36	26.235	No	Yes	0
85	A:A:20	B:B:8	44.11	No	No	0
86	A:A:49	A:A:50	24.205	No	No	0
87	A:A:91	A:A:92	10.205	Yes	No	0
88	A:A:81	A:A:82	0.685	No	No	0
89	A:A:61	A:A:63	0	Yes	No	0
90	A:A:30	A:A:33	20.32	No	No	0
91	A:A:54	A:A:55	0.115	No	No	0
92	A:A:42	A:A:44	0	Yes	No	0
93	A:A:18	A:A:19	0	No	No	0
94	A:A:74	A:A:75	1.58	No	No	0
95	A:A:69	A:A:70	0.015	No	No	0
96	A:A:67	A:A:68	1.73	No	No	0
97	B:B:4	B:B:5	45.74	No	No	0
98	A:A:21	A:A:39	0	No	No	0
99	A:A:22	B:B:6	48.25	Yes	No	0
100	A:A:34	A:A:36	21.485	No	Yes	0
101	A:A:60	A:A:61	0.13	No	Yes	0
102	A:A:12	A:A:13	0	No	Yes	0
103	A:A:60	A:A:88	0.3	No	No	0
104	A:A:46	A:A:47	0	No	No	0
105	B:B:3	B:B:4	27.565	No	No	0
106	A:A:24	A:A:25	0	No	No	0
107	A:A:45	A:A:46	0	No	No	0
108	B:B:6	B:B:7	0	No	No	0
109	A:A:53	A:A:94	11.54	Yes	No	0

Index: link id, click on each number to highlight the corresponding link in the 3D visualization.

Node1 Node2: the two nodes of the corresponding link.

Freq: the trajectory frequency of this link.

Hub1?, Hub2?: "Yes" if the corresponding node has more than 3 links, otherwise "No".

Community: the id of the community the link belong to, otherwise 0.

Value1, Value2: these columns report the values present in the user submitted external values file (if any).

Color	Trajectory Frequency
	0 < Freq. ≤ 10
	10 < Freq. ≤ 20
	20 < Freq. ≤ 30
	30 < Freq. ≤ 40
	40 < Freq. ≤ 50
	50 < Freq. ≤ 60
	60 < Freq. ≤ 70
	70 < Freq. ≤ 80
	80 < Freq. ≤ 90
	90 < Freq. ≤ 100

Index	Hub	Freq	Num Of Links	Community
1	A:A:7	69	4	0
2	A:A:13	0	4	0
3	A:A:22	0	4	0
4	A:A:36	43.265	6	0
5	A:A:42	0	4	0
6	A:A:53	0	4	0
7	A:A:57	42	4	2
8	A:A:61	0	4	0
9	A:A:71	45.77	5	0
10	A:A:76	19.45	4	3
11	A:A:86	47.95	4	1
12	A:A:91	97.775	4	0

Index: hub id, click on each number to highlight the corresponding hub in the 3D visualization.

Hub: the hub being considered.

Freq: the trajectory frequency of the corresponding hub.

Num Of Links: the number of links of the corresponding hub.

Community: the id of the community the link belong to, otherwise 0.

Value: this column reports the value present in the user submitted external values file (if any).

Color	Relative Recurrence (%)
	0 < rr ≤ 10
	10 < rr ≤ 20
	20 < rr ≤ 30
	30 < rr ≤ 40
	40 < rr ≤ 50
	50 < rr ≤ 60
	60 < rr ≤ 70
	70 < rr ≤ 80
	80 < rr ≤ 90
	90 < rr ≤ 100

Index	Node1	Node2	Recurrency	Freq	Hub1?	Hub2?	Community
1	A:A:2	A:A:5	12.0303	100	No	No	0
2	A:A:5	A:A:6	15.1818	100	No	No	0
3	A:A:6	A:A:7	18.2727	100	No	Yes	0
4	A:A:7	A:A:8	24	100	Yes	No	0
5	A:A:7	A:A:89	51.5152	100	Yes	No	0
6	A:A:7	A:A:91	71.2727	100	Yes	Yes	0
7	A:A:8	A:A:86	17.1515	100	No	Yes	1
8	A:A:88	A:A:89	30.5152	100	No	No	0
9	A:A:85	A:A:86	17.5758	100	No	Yes	0
10	A:A:90	A:A:91	100	100	No	Yes	0
11	A:A:57	A:A:90	99.2424	100	Yes	No	0
12	A:A:36	A:A:57	96.7273	100	Yes	Yes	0
13	A:A:23	A:A:36	87.5758	26.235	No	Yes	0
14	A:A:22	A:A:23	84.303	100	Yes	No	0
15	A:A:22	A:A:71	74.5455	100	Yes	Yes	0
16	A:A:71	A:A:75	60.8485	45.97	Yes	No	0
17	A:A:75	A:A:76	57.0606	100	No	Yes	0
18	A:A:76	A:A:80	42.5758	100	Yes	No	3
19	A:A:80	A:A:81	41.7576	100	No	No	0
20	A:A:13	A:A:81	36	100	Yes	No	0
21	A:A:13	A:A:14	15.5758	100	Yes	No	0
22	A:A:13	A:A:16	15.5758	100	Yes	No	0
23	A:A:16	A:A:17	10.1818	100	No	No	0
24	A:A:17	A:A:18	13.6061	100	No	No	0
25	A:A:21	A:A:22	11.9697	100	No	Yes	0
26	A:A:31	A:A:36	26.2424	100	No	Yes	0
27	A:A:30	A:A:31	20.8788	100	No	No	0
28	A:A:29	A:A:30	14.1515	100	No	No	0
29	A:A:28	A:A:29	10.697	100	No	No	0
30	A:A:52	A:A:89	38.0606	100	No	No	0
31	A:A:51	A:A:52	53.6061	100	No	No	0
32	A:A:49	A:A:51	49	100	No	No	0
33	A:A:48	A:A:49	41.3636	100	No	No	0
34	A:A:47	A:A:48	36.6364	100	No	No	0
35	A:A:42	A:A:47	22.0606	100	Yes	No	0
36	A:A:41	A:A:42	10.3333	100	No	Yes	0
37	A:A:52	A:A:53	28.6667	100	No	Yes	0
38	A:A:56	A:A:91	33.3636	100	No	Yes	0
39	A:A:53	A:A:56	31.6061	100	Yes	No	0
40	A:A:60	A:A:88	24.1515	0.3	No	No	0
41	A:A:60	A:A:61	22.3939	0.13	No	Yes	0
42	A:A:61	A:A:64	14.6667	100	Yes	No	0
43	A:A:64	A:A:65	12.697	100	No	No	0
44	A:A:46	A:A:47	10.3333	0	No	No	0

Index: link id, click on each number to highlight the corresponding link in the 3D visualization.

Node1 Node2: the two nodes of the corresponding link.

Recurrency: the relative recurrency in the filtered pool of shortest paths.

Force: the interaction strength between the two nodes.

Hub1?, Hub2?: "Yes" if the corresponding node has more than 3 links, otherwise "No".

Community: the id of the community the link belong to, otherwise 0.

Value1, Value2: these columns report the values present in the user submitted external values file (if any).

Color	Relative Recurrence (%)
	0 < rr ≤ 10
	10 < rr ≤ 20
	20 < rr ≤ 30
	30 < rr ≤ 40
	40 < rr ≤ 50
	50 < rr ≤ 60
	60 < rr ≤ 70
	70 < rr ≤ 80
	80 < rr ≤ 90
	9 < rr ≤ 10

Here, those paths that begin and end at given residue pair(s) or that pass through a residue are used to generate a novel metapath. Such a path filtering is particularly recommended if some information on allosteric residues is available. The selection syntax for a residue pair ("Pairs") is C:C:c534,A:A:?600 (the lower-case "c" stands for cytosine and "?" indicates any non standard amino acid or nucleotide residue). Selection of more than one apical residue pair has the following syntax: C:C:c534,A:A:?600,C:C:c534,A:A:E41. Only one residue can be selected as a tail ("Tail"). For midway residue(s), each residue must be separated by a comma as well e.g. A:A:?600,A:A:E41.

Index	Node1	Node2	Recurrency	Freq	Hub1?	Hub2?	Community	Value1	Value2

Index: link id, click on each number to highlight the corresponding link in the 3D visualization.

Node1 Node2: the two nodes of the corresponding link.

Recurrency: the relative recurrency in the filtered pool of shortest paths.

Freq: the trajectory frequency of this link.

Hub1?, Hub2?: "Yes" if the corresponding node has more than 3 links, otherwise "No".

Community: the id of the community the link belong to, otherwise 0.

Value1, Value2: these columns report the values present in the user submitted external values file (if any).

Download PSN data

2D representation of the global metapath and histograms of path distribution according to several parameters:

2D representation of the user filetered metapath and histograms of path distribution according to several parameters:

Net Summary
I_min	4.59791
Number of Linked Nodes	100
Number of Links	109
Number of Hubs	12
Number of Links mediated by Hubs	48
Number of Communities	3
Number of Nodes involved in Communities	10
Number of Links involved in Communities	11

Path Summary
Number Of Nodes in MetaPath	45
Number Of Links MetaPath	44
Number of Shortest Paths	5886
Length Of Smallest Path	3
Average Path Length	11.6509
Length of Longest Path	26
Minimum Path Force	2.405
Average Path Force	6.19138
Maximum Path Force	10.185
Minimum Path Correlation	0.725
Average Path Correlation	0.882395
Maximum Path Correlation	0.93
Minimum % Of Corr. Nodes	4.34783
Average % Of Corr. Nodes	25.7805
Maximum % Of Corr. Nodes	100
Minimum Path Hubs %	0
Average Path Hubs %	36.0586
Maximum Path Hubs %	75

Filtered Path Summary
Number Of Nodes in MetaPath	available after path filtering
Number Of Links MetaPath	available after path filtering
Number of Shortest Paths	available after path filtering
Length Of Smallest Path	available after path filtering
Average Path Length	available after path filtering
Length of Longest Path	available after path filtering
Minimum Path Force	available after path filtering
Average Path Force	available after path filtering
Maximum Path Force	available after path filtering
Minimum Path Correlation	available after path filtering
Average Path Correlation	available after path filtering
Maximum Path Correlation	available after path filtering
Minimum % Of Corr. Nodes	available after path filtering
Average % Of Corr. Nodes	available after path filtering
Maximum % Of Corr. Nodes	available after path filtering
Minimum Path Hubs %	available after path filtering
Average Path Hubs %	available after path filtering
Maximum Path Hubs %	available after path filtering

Details about the values in these tables can be found in the corresponding documentation page .

The single jobs that make up the consensus run.

3lnx
3lny

Sequence Alignment

;
; msa not aveilable if you choose not to apply labels
;

Labels Table

N	Lab	PresentIn	3lnx	3lny
1	A:A:1	100.00	A:A:P1	A:A:P1
2	A:A:2	100.00	A:A:K2	A:A:K2
3	A:A:3	100.00	A:A:P3	A:A:P3
4	A:A:4	100.00	A:A:G4	A:A:G4
5	A:A:5	100.00	A:A:D5	A:A:D5
6	A:A:6	100.00	A:A:I6	A:A:I6
7	A:A:7	100.00	A:A:F7	A:A:F7
8	A:A:8	100.00	A:A:E8	A:A:E8
9	A:A:9	100.00	A:A:V9	A:A:V9
10	A:A:10	100.00	A:A:E10	A:A:E10
11	A:A:11	100.00	A:A:L11	A:A:L11
12	A:A:12	100.00	A:A:A12	A:A:A12
13	A:A:13	100.00	A:A:K13	A:A:K13
14	A:A:14	100.00	A:A:N14	A:A:N14
15	A:A:15	100.00	A:A:D15	A:A:D15
16	A:A:16	100.00	A:A:N16	A:A:N16
17	A:A:17	100.00	A:A:S17	A:A:S17
18	A:A:18	100.00	A:A:L18	A:A:L18
19	A:A:19	100.00	A:A:G19	A:A:G19
20	A:A:20	100.00	A:A:I20	A:A:I20
21	A:A:21	100.00	A:A:S21	A:A:S21
22	A:A:22	100.00	A:A:V22	A:A:V22
23	A:A:23	100.00	A:A:T23	A:A:T23
24	A:A:24	100.00	A:A:G24	A:A:G24
25	A:A:25	100.00	A:A:G25	A:A:G25
26	A:A:26	100.00	A:A:V26	A:A:V26
27	A:A:27	100.00	A:A:N27	A:A:N27
28	A:A:28	100.00	A:A:T28	A:A:T28
29	A:A:29	100.00	A:A:S29	A:A:S29
30	A:A:30	100.00	A:A:V30	A:A:V30
31	A:A:31	100.00	A:A:R31	A:A:R31
32	A:A:32	100.00	A:A:H32	A:A:H32
33	A:A:33	100.00	A:A:G33	A:A:G33
34	A:A:34	100.00	A:A:G34	A:A:G34
35	A:A:35	100.00	A:A:I35	A:A:I35
36	A:A:36	100.00	A:A:Y36	A:A:Y36
37	A:A:37	100.00	A:A:V37	A:A:V37
38	A:A:38	100.00	A:A:K38	A:A:K38
39	A:A:39	100.00	A:A:A39	A:A:A39
40	A:A:40	100.00	A:A:V40	A:A:V40
41	A:A:41	100.00	A:A:I41	A:A:I41
42	A:A:42	100.00	A:A:P42	A:A:P42
43	A:A:43	100.00	A:A:Q43	A:A:Q43
44	A:A:44	100.00	A:A:G44	A:A:G44
45	A:A:45	100.00	A:A:A45	A:A:A45
46	A:A:46	100.00	A:A:A46	A:A:A46
47	A:A:47	100.00	A:A:E47	A:A:E47
48	A:A:48	100.00	A:A:S48	A:A:S48
49	A:A:49	100.00	A:A:D49	A:A:D49
50	A:A:50	100.00	A:A:G50	A:A:G50
51	A:A:51	100.00	A:A:R51	A:A:R51
52	A:A:52	100.00	A:A:I52	A:A:I52
53	A:A:53	100.00	A:A:H53	A:A:H53
54	A:A:54	100.00	A:A:K54	A:A:K54
55	A:A:55	100.00	A:A:G55	A:A:G55
56	A:A:56	100.00	A:A:D56	A:A:D56
57	A:A:57	100.00	A:A:R57	A:A:R57
58	A:A:58	100.00	A:A:V58	A:A:V58
59	A:A:59	100.00	A:A:L59	A:A:L59
60	A:A:60	100.00	A:A:A60	A:A:A60
61	A:A:61	100.00	A:A:V61	A:A:V61
62	A:A:62	100.00	A:A:N62	A:A:N62
63	A:A:63	100.00	A:A:G63	A:A:G63
64	A:A:64	100.00	A:A:V64	A:A:V64
65	A:A:65	100.00	A:A:S65	A:A:S65
66	A:A:66	100.00	A:A:L66	A:A:L66
67	A:A:67	100.00	A:A:E67	A:A:E67
68	A:A:68	100.00	A:A:G68	A:A:G68
69	A:A:69	100.00	A:A:A69	A:A:A69
70	A:A:70	100.00	A:A:T70	A:A:T70
71	A:A:71	100.00	A:A:H71	A:A:H71
72	A:A:72	100.00	A:A:K72	A:A:K72
73	A:A:73	100.00	A:A:Q73	A:A:Q73
74	A:A:74	100.00	A:A:A74	A:A:A74
75	A:A:75	100.00	A:A:V75	A:A:V75
76	A:A:76	100.00	A:A:E76	A:A:E76
77	A:A:77	100.00	A:A:T77	A:A:T77
78	A:A:78	100.00	A:A:L78	A:A:L78
79	A:A:79	100.00	A:A:R79	A:A:R79
80	A:A:80	100.00	A:A:N80	A:A:N80
81	A:A:81	100.00	A:A:T81	A:A:T81
82	A:A:82	100.00	A:A:G82	A:A:G82
83	A:A:83	100.00	A:A:Q83	A:A:Q83
84	A:A:84	100.00	A:A:V84	A:A:V84
85	A:A:85	100.00	A:A:V85	A:A:V85
86	A:A:86	100.00	A:A:H86	A:A:H86
87	A:A:87	100.00	A:A:L87	A:A:L87
88	A:A:88	100.00	A:A:L88	A:A:L88
89	A:A:89	100.00	A:A:L89	A:A:L89
90	A:A:90	100.00	A:A:E90	A:A:E90
91	A:A:91	100.00	A:A:K91	A:A:K91
92	A:A:92	100.00	A:A:G92	A:A:G92
93	A:A:93	100.00	A:A:Q93	A:A:Q93
94	A:A:94	100.00	A:A:S94	A:A:S94
95	B:B:3	50.00	-	B:B:E3
96	B:B:4	50.00	-	B:B:Q4
97	B:B:5	50.00	-	B:B:V5
98	B:B:6	50.00	-	B:B:S6
99	B:B:7	50.00	-	B:B:A7
100	B:B:8	50.00	-	B:B:V8

Trj Stats Plots:

Stat 1	Stat 2	Documentation

You can download a compressed (zip) file with all submitted structures, 3D outputs (as PyMol and VMD scripts) and numerical data files (as csv and plain text files). The zip bundle also contains an output manual explaining the meaning of all files and numerical data.

Download webpsn_output_jobw673nl3n.zip